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#bioinformatics

Alle Repositories im öffentlichen Register, die dieses Tag tragen — aus ihren GitHub-Topics oder den von ihren Paket-Registries veröffentlichten Schlagwörtern. Die Gesundheit wird nach derselben versionierten Methodik gemessen wie im übrigen Register.

101 Einträge
Getaggt als „bioinformatics“Geordnet nach Gesundheitsindex
PyPI
51MittelGesundheitsindex
kmaneesh/biopython-mcp
MCP interface to BioPython
Python★ 2↓ 503/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI · npm
50MittelGesundheitsindex
N283T/pdb-mine-builder
Build a Mine-schema database from PDB data. Load PDBj structural biology data into PostgreSQL with RDKit chemical search support.
Python★ 0↓ 1.096/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
npm
50MittelGesundheitsindex
labiomics/aramas
Plataforma educacional imersiva e gamificada projetada para o ensino de Linux e Bioinformática.
TypeScript★ 1↓ 87/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
50MittelGesundheitsindex
pdbeurope/investigations
This application is designed to create mmcif files from facilities data.
Python★ 6↓ 1.071/Monat15. Juli 2026
Keine Lizenz15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
49GefährdetGesundheitsindex
PDBEurope/mmcif-gen
This application is designed to create mmcif files from facilities data.
Python★ 617. Juli 2026
Keine Lizenz17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
crates.io · npm
49GefährdetGesundheitsindex
tkanx/bio-forge
A high-performance, pure Rust toolkit for standardizing and preparing biomolecular systems (proteins & nucleic acids). It heals missing atoms, resolves protonation states, adds solvation, and unifies topologies to forge simulation-ready structures.
Rust · TypeScript★ 14115. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
48GefährdetGesundheitsindex
AkhilTeja2209/Proteinspy
Python library and a CLI tool to analyze protein sample files
Python★ 0↓ 975/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
Go
48GefährdetGesundheitsindex
TaqsBlaze/FlamingoDB
FlamingoDB is an open source scientific database engine built to empower researchers, scientists, and developers with efficient tools for managing, querying, and analyzing complex scientific datasets.
Go · HTML★ 617. Juli 2026
MIT17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
npm
48GefährdetGesundheitsindex
juliocesar-io/nano-protein-viewer-react
React component for visualizing protein structures with the Mol* framework.
TypeScript★ 8↓ 710/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
46GefährdetGesundheitsindex
JinyuanSun/PymolFold
Protein folding in Pymol
Python★ 149↓ 455/Monat17. Juli 2026
MIT17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
46GefährdetGesundheitsindex
bioexcel/biobb
Biobb (BioExcel building blocks) packages are Python building blocks that create new layer of compatibility and interoperability over popular bioinformatics tools.
Python★ 67↓ 338/Monat17. Juli 2026
Apache-2.017. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
45GefährdetGesundheitsindex
Ruibin-Liu/pdbx2df
Super lightweight and fast mmCIF/PDB/MOL2 file parser into Pandas DataFrames and backwards writer.
Python★ 1115. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
45GefährdetGesundheitsindex
bioexcel/biobb_pdb_tools
Keine Repository-Beschreibung veröffentlicht.
Python★ 015. Juli 2026
Apache-2.015. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
45GefährdetGesundheitsindex
gqy20/protein-mcp
FastMCP-based protein data access tools for bioinformatics research
Python★ 0↓ 682/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
43GefährdetGesundheitsindex
PDBeurope/pdbecif
A lightweight pure python package for reading, writing and manipulating mmCIF files distributed by the wwPDB"
Python★ 38↓ 8.169/Monat17. Juli 2026
Apache-2.017. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
43GefährdetGesundheitsindex
a-r-j/cpdb
Cython implementation of PDB -> DataFrame parsing
Cython · Jupyter Notebook · Python★ 34↓ 20.1K/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
crates.io
43GefährdetGesundheitsindex
caltechmsc/dreid-pack
A high-performance, pure Rust library for full-atom protein side-chain packing using the DREIDING force field, Goldstein+Split DEE, and tree-decomposition DP—with native protein–ligand and protein–nucleic acid interface support.
Rust★ 217. Juli 2026
MIT17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
npm
43GefährdetGesundheitsindex
tianqitang1/enrichr-mcp-server
Keine Repository-Beschreibung veröffentlicht.
TypeScript · JavaScript★ 15↓ 459/Monat17. Juli 2026
Keine Lizenz17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
—
43GefährdetGesundheitsindex
uclorengogroup/cath-tools
Protein structure comparison tools such as SSAP and SNAP
C++ · Promela★ 6715. Juli 2026
GPL-3.015. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
42GefährdetGesundheitsindex
laurentrdc/crystals
Data structures, algorithms, and parsing for crystallography
Python★ 56↓ 6.850/Monat15. Juli 2026
GPL-3.015. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
npm
41GefährdetGesundheitsindex
molbiohive/hatchlings
Svelte 5 molecular biology component library.
Svelte · TypeScript★ 2↓ 324/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
—
40GefährdetGesundheitsindex
CDCgov/label
Lineage and clade classifier for influenza sequences
Perl · Shell★ 421. Juli 2026
Apache-2.021. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
40GefährdetGesundheitsindex
bioexcel/biobb_md
Biobb_md is the Biobb module collection to perform molecular dynamics simulations.
Python★ 7↓ 417/Monat17. Juli 2026
Apache-2.017. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
npm
40GefährdetGesundheitsindex
goginea/aws-healthomics-ai-troubleshooting-assistant
AI-assisted troubleshooting for AWS HealthOmics genomic workflows with custom knowledge base support
TypeScript★ 0↓ 100/Monat17. Juli 2026
Eigene Lizenz17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI · npm
40GefährdetGesundheitsindex
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
Keine Repository-Beschreibung veröffentlicht.
TypeScript★ 117. Juli 2026
MIT17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
39GefährdetGesundheitsindex
mr-eyes/cifi-toolkit
Toolkit for downstream processing of CiFi long reads.
C++ · Python★ 515. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
npm
38GefährdetGesundheitsindex
ppillot/biomsalign
JavaScript library for Multiple Sequence Alignment
TypeScript★ 26↓ 23K/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
36GefährdetGesundheitsindex
amorehead/pdb-tools
A dependency-free cross-platform swiss army knife for PDB files.
Python★ 0↓ 995/Monat15. Juli 2026
Apache-2.015. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
36GefährdetGesundheitsindex
brinkmanlab/biopython-convert
Tool to interconvert between various bioinformatics formats that BioPython supports
Roff★ 4↓ 352/Monat15. Juli 2026
Eigene Lizenz15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
36GefährdetGesundheitsindex
jpuglia/proteinloc
Keine Repository-Beschreibung veröffentlicht.
Python★ 015. Juli 2026
Keine Lizenz15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0