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#bioinformatics

Todos los repositorios del registro público que llevan esta etiqueta, procedente de sus topics de GitHub o de las palabras clave que publican sus registros de paquetes. La salud se mide con la misma metodología versionada que el resto del registro.

101 registros
Con la etiqueta «bioinformatics»Ordenado por índice de salud
PyPI
51Moderadoíndice de salud
kmaneesh/biopython-mcp
MCP interface to BioPython
Python★ 2↓ 503/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · npm
50Moderadoíndice de salud
N283T/pdb-mine-builder
Build a Mine-schema database from PDB data. Load PDBj structural biology data into PostgreSQL with RDKit chemical search support.
Python★ 0↓ 1096/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
50Moderadoíndice de salud
labiomics/aramas
Plataforma educacional imersiva e gamificada projetada para o ensino de Linux e Bioinformática.
TypeScript★ 1↓ 87/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
50Moderadoíndice de salud
pdbeurope/investigations
This application is designed to create mmcif files from facilities data.
Python★ 6↓ 1071/mes15 jul 2026
Sin licencia15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
49En riesgoíndice de salud
PDBEurope/mmcif-gen
This application is designed to create mmcif files from facilities data.
Python★ 617 jul 2026
Sin licencia17 jul 2026 · métricas 1.13.0
crates.io · npm
49En riesgoíndice de salud
tkanx/bio-forge
A high-performance, pure Rust toolkit for standardizing and preparing biomolecular systems (proteins & nucleic acids). It heals missing atoms, resolves protonation states, adds solvation, and unifies topologies to forge simulation-ready structures.
Rust · TypeScript★ 14115 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
48En riesgoíndice de salud
AkhilTeja2209/Proteinspy
Python library and a CLI tool to analyze protein sample files
Python★ 0↓ 975/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
Go
48En riesgoíndice de salud
TaqsBlaze/FlamingoDB
FlamingoDB is an open source scientific database engine built to empower researchers, scientists, and developers with efficient tools for managing, querying, and analyzing complex scientific datasets.
Go · HTML★ 617 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
48En riesgoíndice de salud
juliocesar-io/nano-protein-viewer-react
React component for visualizing protein structures with the Mol* framework.
TypeScript★ 8↓ 710/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
46En riesgoíndice de salud
JinyuanSun/PymolFold
Protein folding in Pymol
Python★ 149↓ 455/mes17 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
46En riesgoíndice de salud
bioexcel/biobb
Biobb (BioExcel building blocks) packages are Python building blocks that create new layer of compatibility and interoperability over popular bioinformatics tools.
Python★ 67↓ 338/mes17 jul 2026
Apache-2.017 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
45En riesgoíndice de salud
Ruibin-Liu/pdbx2df
Super lightweight and fast mmCIF/PDB/MOL2 file parser into Pandas DataFrames and backwards writer.
Python★ 1115 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
45En riesgoíndice de salud
bioexcel/biobb_pdb_tools
El repositorio no publica descripción.
Python★ 015 jul 2026
Apache-2.015 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
45En riesgoíndice de salud
gqy20/protein-mcp
FastMCP-based protein data access tools for bioinformatics research
Python★ 0↓ 682/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
43En riesgoíndice de salud
PDBeurope/pdbecif
A lightweight pure python package for reading, writing and manipulating mmCIF files distributed by the wwPDB"
Python★ 38↓ 8169/mes17 jul 2026
Apache-2.017 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
43En riesgoíndice de salud
a-r-j/cpdb
Cython implementation of PDB -> DataFrame parsing
Cython · Jupyter Notebook · Python★ 34↓ 20.1K/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
crates.io
43En riesgoíndice de salud
caltechmsc/dreid-pack
A high-performance, pure Rust library for full-atom protein side-chain packing using the DREIDING force field, Goldstein+Split DEE, and tree-decomposition DP—with native protein–ligand and protein–nucleic acid interface support.
Rust★ 217 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
43En riesgoíndice de salud
tianqitang1/enrichr-mcp-server
El repositorio no publica descripción.
TypeScript · JavaScript★ 15↓ 459/mes17 jul 2026
Sin licencia17 jul 2026 · métricas 1.13.0
—
43En riesgoíndice de salud
uclorengogroup/cath-tools
Protein structure comparison tools such as SSAP and SNAP
C++ · Promela★ 6715 jul 2026
GPL-3.015 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
42En riesgoíndice de salud
laurentrdc/crystals
Data structures, algorithms, and parsing for crystallography
Python★ 56↓ 6850/mes15 jul 2026
GPL-3.015 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
41En riesgoíndice de salud
molbiohive/hatchlings
Svelte 5 molecular biology component library.
Svelte · TypeScript★ 2↓ 324/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
—
40En riesgoíndice de salud
CDCgov/label
Lineage and clade classifier for influenza sequences
Perl · Shell★ 421 jul 2026
Apache-2.021 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
40En riesgoíndice de salud
bioexcel/biobb_md
Biobb_md is the Biobb module collection to perform molecular dynamics simulations.
Python★ 7↓ 417/mes17 jul 2026
Apache-2.017 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
40En riesgoíndice de salud
goginea/aws-healthomics-ai-troubleshooting-assistant
AI-assisted troubleshooting for AWS HealthOmics genomic workflows with custom knowledge base support
TypeScript★ 0↓ 100/mes17 jul 2026
Licencia propia17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · npm
40En riesgoíndice de salud
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
El repositorio no publica descripción.
TypeScript★ 117 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
39En riesgoíndice de salud
mr-eyes/cifi-toolkit
Toolkit for downstream processing of CiFi long reads.
C++ · Python★ 515 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
38En riesgoíndice de salud
ppillot/biomsalign
JavaScript library for Multiple Sequence Alignment
TypeScript★ 26↓ 23K/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
36En riesgoíndice de salud
amorehead/pdb-tools
A dependency-free cross-platform swiss army knife for PDB files.
Python★ 0↓ 995/mes15 jul 2026
Apache-2.015 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
36En riesgoíndice de salud
brinkmanlab/biopython-convert
Tool to interconvert between various bioinformatics formats that BioPython supports
Roff★ 4↓ 352/mes15 jul 2026
Licencia propia15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
36En riesgoíndice de salud
jpuglia/proteinloc
El repositorio no publica descripción.
Python★ 015 jul 2026
Sin licencia15 jul 2026 · métricas 1.13.0