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#single-cell

Alle Repositories im öffentlichen Register, die dieses Tag tragen — aus ihren GitHub-Topics oder den von ihren Paket-Registries veröffentlichten Schlagwörtern. Die Gesundheit wird nach derselben versionierten Methodik gemessen wie im übrigen Register.

13 Einträge
Getaggt als „single-cell“Geordnet nach Gesundheitsindex
PyPI
95AußergewöhnlichGesundheitsindex
scverse/pertpy
Single-cell perturbation analysis
Python★ 337↓ 7.588/Monat24. Aug. 2026
MIT24. Aug. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
90ExzellentGesundheitsindex
scverse/rapids-singlecell
rapids-singlecell: GPU-accelerated framework for scRNA analysis
Python · Cuda★ 38620. Juli 2026
MIT20. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
88ExzellentGesundheitsindex
saezlab/liana-py
LIANA+: an all-in-one framework for cell-cell communication
Python★ 30521. Juli 2026
BSD-3-Clause21. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
npm
88ExzellentGesundheitsindex
vitessce/vitessce
Vitessce is a visual integration tool for exploration of spatial single-cell experiments.
JavaScript · TypeScript★ 260↓ 42.9K/Monat26. Juli 2026
MIT26. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
87ExzellentGesundheitsindex
ablab/IsoQuant
Transcript discovery and quantification with long RNA reads (Nanopores and PacBio)
Python★ 23317. Juli 2026
Eigene Lizenz17. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
crates.io · npm
80ExzellentGesundheitsindex
COMBINE-lab/salmon
🐟 🍣 🍱 Highly-accurate & wicked fast transcript-level quantification from RNA-seq reads using selective alignment
Rust★ 91816. Juli 2026
BSD-3-Clause16. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
80ExzellentGesundheitsindex
cafferychen777/mLLMCelltype
Cell type annotation for single-cell RNA-seq using multi-LLM consensus
Python · R★ 655↓ 285/Monat2. Aug. 2026
MIT2. Aug. 2026 · Metriken 2.10.0
crates.io · npm · PyPI
71GutGesundheitsindex
COMBINE-lab/simpleaf
A rust framework to make using alevin-fry even simpler
Rust★ 67↓ 82/Monat22. Aug. 2026
BSD-3-Clause22. Aug. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI · Go
65GutGesundheitsindex
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 4215. Juli 2026
Eigene Lizenz15. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI · npm
62MittelGesundheitsindex
vitessce/vitessce-python
Python API and Jupyter widget for Vitessce
Python★ 6726. Juli 2026
MIT26. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
50MittelGesundheitsindex
jamesjcai/scGEAToolbox
scGEAToolbox: Matlab toolbox for single-cell gene expression analyses
MATLAB★ 3020. Juli 2026
MIT20. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI · npm
36SchwachGesundheitsindex
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
Keine Repository-Beschreibung veröffentlicht.
TypeScript★ 117. Juli 2026
MIT17. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
35SchwachGesundheitsindex
Teichlab/Genes2Genes
Aligning gene expression trajectories of single-cell reference and query systems
Jupyter Notebook★ 8926. Juli 2026
MIT26. Juli 2026 · Metriken 2.10.0