PyPI
scverse/pertpy
Single-cell perturbation analysis
MIT24 серп. 2026 р. · метрики 2.10.0
Усі теги
Тег каталогу
#single-cell
Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.
13 записів
PyPI
scverse/rapids-singlecell
rapids-singlecell: GPU-accelerated framework for scRNA analysis
MIT20 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
saezlab/liana-py
LIANA+: an all-in-one framework for cell-cell communication
BSD-3-Clause21 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
vitessce/vitessce
Vitessce is a visual integration tool for exploration of spatial single-cell experiments.
MIT26 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
ablab/IsoQuant
Transcript discovery and quantification with long RNA reads (Nanopores and PacBio)
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
crates.io · npm
COMBINE-lab/salmon
🐟 🍣 🍱 Highly-accurate & wicked fast transcript-level quantification from RNA-seq reads using selective alignment
BSD-3-Clause16 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
cafferychen777/mLLMCelltype
Cell type annotation for single-cell RNA-seq using multi-LLM consensus
MIT2 серп. 2026 р. · метрики 2.10.0
crates.io · npm · PyPI
COMBINE-lab/simpleaf
A rust framework to make using alevin-fry even simpler
BSD-3-Clause22 серп. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · Go
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Власна ліцензія15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
vitessce/vitessce-python
Python API and Jupyter widget for Vitessce
MIT26 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
jamesjcai/scGEAToolbox
scGEAToolbox: Matlab toolbox for single-cell gene expression analyses
MIT20 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
Опис репозиторію не опубліковано.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
Teichlab/Genes2Genes
Aligning gene expression trajectories of single-cell reference and query systems
MIT26 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0