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#single-cell

Todos los repositorios del registro público que llevan esta etiqueta, procedente de sus topics de GitHub o de las palabras clave que publican sus registros de paquetes. La salud se mide con la misma metodología versionada que el resto del registro.

13 registros
Con la etiqueta «single-cell»Ordenado por índice de salud
PyPI
95Excepcionalíndice de salud
scverse/pertpy
Single-cell perturbation analysis
Python★ 337↓ 7588/mes24 ago 2026
MIT24 ago 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
90Excelenteíndice de salud
scverse/rapids-singlecell
rapids-singlecell: GPU-accelerated framework for scRNA analysis
Python · Cuda★ 38620 jul 2026
MIT20 jul 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
88Excelenteíndice de salud
saezlab/liana-py
LIANA+: an all-in-one framework for cell-cell communication
Python★ 30521 jul 2026
BSD-3-Clause21 jul 2026 · métricas 2.10.0
npm
88Excelenteíndice de salud
vitessce/vitessce
Vitessce is a visual integration tool for exploration of spatial single-cell experiments.
JavaScript · TypeScript★ 260↓ 42.9K/mes26 jul 2026
MIT26 jul 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
87Excelenteíndice de salud
ablab/IsoQuant
Transcript discovery and quantification with long RNA reads (Nanopores and PacBio)
Python★ 23317 jul 2026
Licencia propia17 jul 2026 · métricas 2.10.0
crates.io · npm
80Excelenteíndice de salud
COMBINE-lab/salmon
🐟 🍣 🍱 Highly-accurate & wicked fast transcript-level quantification from RNA-seq reads using selective alignment
Rust★ 91816 jul 2026
BSD-3-Clause16 jul 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
80Excelenteíndice de salud
cafferychen777/mLLMCelltype
Cell type annotation for single-cell RNA-seq using multi-LLM consensus
Python · R★ 655↓ 285/mes2 ago 2026
MIT2 ago 2026 · métricas 2.10.0
crates.io · npm · PyPI
71Buenoíndice de salud
COMBINE-lab/simpleaf
A rust framework to make using alevin-fry even simpler
Rust★ 67↓ 82/mes22 ago 2026
BSD-3-Clause22 ago 2026 · métricas 2.10.0
PyPI · Go
65Buenoíndice de salud
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 4215 jul 2026
Licencia propia15 jul 2026 · métricas 2.10.0
PyPI · npm
62Moderadoíndice de salud
vitessce/vitessce-python
Python API and Jupyter widget for Vitessce
Python★ 6726 jul 2026
MIT26 jul 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
50Moderadoíndice de salud
jamesjcai/scGEAToolbox
scGEAToolbox: Matlab toolbox for single-cell gene expression analyses
MATLAB★ 3020 jul 2026
MIT20 jul 2026 · métricas 2.10.0
PyPI · npm
36Débilíndice de salud
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
El repositorio no publica descripción.
TypeScript★ 117 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
35Débilíndice de salud
Teichlab/Genes2Genes
Aligning gene expression trajectories of single-cell reference and query systems
Jupyter Notebook★ 8926 jul 2026
MIT26 jul 2026 · métricas 2.10.0