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#single-cell

公开记录中带有此标签的全部仓库——标签来自其 GitHub 主题或软件包注册表发布的关键词。健康度量遵循与记录其余部分相同的版本化方法论。

13 条记录
标签为“single-cell”按健康指数排序
PyPI
95卓越健康指数
scverse/pertpy
Single-cell perturbation analysis
Python★ 337↓ 7,588/月2026年8月24日
MIT2026年8月24日 · 指标 2.10.0
PyPI
90优秀健康指数
scverse/rapids-singlecell
rapids-singlecell: GPU-accelerated framework for scRNA analysis
Python · Cuda★ 3862026年7月20日
MIT2026年7月20日 · 指标 2.10.0
PyPI
88优秀健康指数
saezlab/liana-py
LIANA+: an all-in-one framework for cell-cell communication
Python★ 3052026年7月21日
BSD-3-Clause2026年7月21日 · 指标 2.10.0
npm
88优秀健康指数
vitessce/vitessce
Vitessce is a visual integration tool for exploration of spatial single-cell experiments.
JavaScript · TypeScript★ 260↓ 42.9K/月2026年7月26日
MIT2026年7月26日 · 指标 2.10.0
PyPI
87优秀健康指数
ablab/IsoQuant
Transcript discovery and quantification with long RNA reads (Nanopores and PacBio)
Python★ 2332026年7月17日
自定义许可证2026年7月17日 · 指标 2.10.0
crates.io · npm
80优秀健康指数
COMBINE-lab/salmon
🐟 🍣 🍱 Highly-accurate & wicked fast transcript-level quantification from RNA-seq reads using selective alignment
Rust★ 9182026年7月16日
BSD-3-Clause2026年7月16日 · 指标 2.10.0
PyPI
80优秀健康指数
cafferychen777/mLLMCelltype
Cell type annotation for single-cell RNA-seq using multi-LLM consensus
Python · R★ 655↓ 285/月2026年8月2日
MIT2026年8月2日 · 指标 2.10.0
crates.io · npm · PyPI
71良好健康指数
COMBINE-lab/simpleaf
A rust framework to make using alevin-fry even simpler
Rust★ 67↓ 82/月2026年8月22日
BSD-3-Clause2026年8月22日 · 指标 2.10.0
PyPI · Go
65良好健康指数
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 422026年7月15日
自定义许可证2026年7月15日 · 指标 2.10.0
PyPI · npm
62中等健康指数
vitessce/vitessce-python
Python API and Jupyter widget for Vitessce
Python★ 672026年7月26日
MIT2026年7月26日 · 指标 2.10.0
PyPI
50中等健康指数
jamesjcai/scGEAToolbox
scGEAToolbox: Matlab toolbox for single-cell gene expression analyses
MATLAB★ 302026年7月20日
MIT2026年7月20日 · 指标 2.10.0
PyPI · npm
36薄弱健康指数
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
该仓库未发布描述。
TypeScript★ 12026年7月17日
MIT2026年7月17日 · 指标 2.10.0
PyPI
35薄弱健康指数
Teichlab/Genes2Genes
Aligning gene expression trajectories of single-cell reference and query systems
Jupyter Notebook★ 892026年7月26日
MIT2026年7月26日 · 指标 2.10.0