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#proteomics

Todos los repositorios del registro público que llevan esta etiqueta, procedente de sus topics de GitHub o de las palabras clave que publican sus registros de paquetes. La salud se mide con la misma metodología versionada que el resto del registro.

18 registros
Con la etiqueta «proteomics»Ordenado por índice de salud
PyPI
92Excelenteíndice de salud
PixelgenTechnologies/pixelator
A command-line tool and library to process and analyze sequencing data from Molecular Pixelation (MPX) and Proximity Network (PNA) assays.
Python★ 22↓ 169/mes19 oct 2026
MIT19 oct 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
89Excelenteíndice de salud
bigbio/qpx
qpx (Quantitative Proteomics eXchange) format (aka quantms.io) a format to capture a full proteomics experiment
Python★ 26↓ 207/mes19 oct 2026
Apache-2.019 oct 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
88Excelenteíndice de salud
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
Turn any AI agent into an AI Scientist. The #1 Agent Skills library for science, used by 190,000+ scientists worldwide. 165 ready-to-use validated skills plus 100+ scientific databases covering biology, chemistry, medicine, and drug discovery. Compatible with Cursor, Claude Code, Codex, Pi, Antigravity, and the open Agent Skills standard.
Python★ 45.2K16 sept 2026
MIT16 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
84Excelenteíndice de salud
CompOmics/ms2rescore
Modular and user-friendly platform for AI-assisted rescoring of peptide identifications
Python★ 66↓ 21.8K/mes14 sept 2026
Apache-2.014 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI · crates.io · npm
83Excelenteíndice de salud
Sigilweaver/OpenTFRaw
Pure-Rust reader for Thermo Fisher .raw mass-spectrometry files, with Python bindings.
Rust★ 13↓ 7263/mes8 sept 2026
Licencia propia8 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
78Buenoíndice de salud
CompOmics/ms2pip
MS²PIP: Fast and accurate peptide spectrum prediction for multiple fragmentation methods, instruments, and labeling techniques.
HTML · Jupyter Notebook★ 50↓ 23.7K/mes14 sept 2026
Apache-2.014 sept 2026 · métricas 2.10.0
npm
77Buenoíndice de salud
cyanheads/uniprot-mcp-server
Search UniProtKB by protein function, fetch curated records, map IDs across databases, and pull reference proteomes, taxonomy, and sequences via MCP. STDIO or Streamable HTTP.
TypeScript★ 2↓ 946/mes18 oct 2026
Apache-2.018 oct 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
75Buenoíndice de salud
MannLabs/alphapeptdeep
Deep learning framework for proteomics
Jupyter Notebook★ 15819 sept 2026
Apache-2.019 sept 2026 · métricas 2.10.0
crates.io
75Buenoíndice de salud
Sigilweaver/OpenMassSpecCore
Shared core types and traits for the OpenProteo proteomics reader family.
Rust★ 1↓ 2196/mes13 oct 2026
Licencia propia13 oct 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
73Buenoíndice de salud
MannLabs/alpharaw
An open-source Python package to unify raw MS data accession and storage.
Python · Jupyter Notebook★ 36↓ 4389/mes19 oct 2026
Apache-2.019 oct 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
71Buenoíndice de salud
TimoLassmann/kalign
A fast multiple sequence alignment program.
C · Python★ 162↓ 9617/mes19 sept 2026
Apache-2.019 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI · Go
71Buenoíndice de salud
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 45↓ 765/mes8 sept 2026
Licencia propia8 sept 2026 · métricas 2.10.0
—
65Buenoíndice de salud
Vitek-Lab/MSstatsConvert
Converter functions for the MSstats package
R★ 1212 sept 2026
Licencia propia12 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI · npm
65Buenoíndice de salud
bijux/bijux-proteomics
El repositorio no publica descripción.
Python★ 2↓ 56/mes8 sept 2026
Apache-2.08 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
63Moderadoíndice de salud
MannLabs/alphaquant
An open-source Python package for accurate and sensitive peptide and protein quantification.
Python · Jupyter Notebook★ 21↓ 655/mes16 oct 2026
Apache-2.016 oct 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
51Moderadoíndice de salud
bigbio/quantms-rescoring
quantms and ms2rescore helper functions and scripts
Python★ 1↓ 205/mes19 sept 2026
Apache-2.019 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
45Débilíndice de salud
Bio2Byte/scop3p-api-client
The official Scop3P REST API Python client for retrieving phospho-sites
Python★ 0↓ 97/mes8 sept 2026
Licencia propia8 sept 2026 · métricas 2.10.0
npm
16Críticoíndice de salud
biojs/generator-biojs-webcomponents
Generate all the boilerplate for your next BioJS tool!
JavaScript★ 10↓ 20/mes9 sept 2026
MIT9 sept 2026 · métricas 2.10.0