A fast multiple sequence alignment program.
TimoLassmann/kalign має індекс здоров’я 71 зі 100, що відповідає смузі «Добрий». Найвищий показник — Engineering Quality (90/100), найнижчий — Vitality (51/100). Останнє оновлення було 58 днів тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.
Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).
Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.
Зважений загальний бал 63 калібровано до 71 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).
Цей репозиторій належить особистому обліковому запису. Проєкт з єдиним власником несе більший ризик безперервності, ніж підтримуваний організацією.
| Реєстр | Пакет | Версія | Завантажень / міс | Версії | Остання публікація | Теги |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PyPI | kalign-python | 3.6.0 | 9 617 | 5 | 125 днів тому | bioinformaticssequence-alignmentmultiple-sequence-alignmentmsacomputational-biologygenomicsproteomicsphylogenetic-analysisevolutionary-biologybiopythonscikit-biodna-alignmentprotein-alignmentrna-alignmentfast-alignmentparallel-alignmentsimd-optimization |
Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?
| 18/36 | Свіжість push — останній push 58 дн. тому |
| 8.3/36 | Ритм комітів — 12/52 тижнів із комітами |
| 17/18 | Обсяг комітів — 77 комітів за останній рік |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Maintained — 1 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0 |
| commits_last_year | 77 |
| human_commit_share | 1 |
| days_since_last_push | 58 |
| active_weeks_last_year | 12 |
| 27/27 | Випускає релізи — опубліковано 13 релізів |
| 16.2/36 | Свіжість релізів — останній реліз 203 дн. тому |
| 12.6/27 | Ритм релізів — реліз кожні ~243,9 дн. |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних |
| releases_count | 13 |
| latest_release_tag | v3.5.1 |
| releases_from_tags | ні |
| days_since_latest_release | 203 |
| mean_days_between_releases | 243,9 |
Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?
| 35.8/60 | Зірки — 162 зірок |
| 12.9/25 | Форки — 36 форків |
| 3.3/15 | Спостерігачі — 5 спостерігачів |
| forks | 36 |
| stars | 162 |
| watchers | 5 |
| growth_state | unverified |
| growth_factor_pct | 100 |
| growth_unverified_reason | no_history |
| 22.5/22.5 | README |
| 22.5/22.5 | Ліцензія — визнана ліцензія (Apache-2.0) |
| 18/18 | Настанови CONTRIBUTING |
| 0/13.5 | Кодекс поведінки |
| 0/7.2 | Шаблон issue |
| 0/6.3 | Шаблон PR |
| has_readme | так |
| has_license | так |
| readme_badges | 4 |
| has_contributing | так |
| has_issue_template | ні |
| has_code_of_conduct | ні |
| readme_badge_services | github.com |
| has_pull_request_template | ні |
| 53.1/80 | Щомісячні завантаження — 9 617 завантажень/місяць у pypi |
| 0/20 | Залежні пакети в реєстрі — ця екосистема цього не повідомляє |
| packages | kalign-python |
| dependents | — |
| ecosystems | pypi |
| total_downloads | — |
| monthly_downloads | 9 617 |
| unverified_packages_excluded | — |
Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?
| 9/54 | Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів |
| 3.6/22.5 | Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 84% комітів |
| 8.1/13.5 | Широта контриб’юторів — 6 контриб’юторів |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 0 contributing companies or organizations -- score normalized to 0 |
| bus_factor | 1 |
| contributors_sampled | 6 |
| top_contributor_share | 0,842 |
| 42/42 | Вирішення issue — закрито 100% issue |
| 12/30 | Прийняття PR — злито 6/15 вирішених PR |
| 0/13 | Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка |
| 0/15 | OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/4 approved changesets -- score normalized to 0 |
| merged_prs | 6 |
| open_issues | 0 |
| closed_issues | 47 |
| prs_merged_7d | 0 |
| prs_decided_7d | 0 |
| prs_merged_30d | 0 |
| prs_decided_30d | 0 |
| issue_closed_ratio | 1 |
| closed_unmerged_prs | 9 |
| first_time_authors_30d | 0 |
| first_time_prs_merged_30d | 0 |
| first_time_prs_decided_30d | 0 |
| 10/30 | Підтримка власника — особистий (користувацький) обліковий запис |
| 0/20 | Верифікований домен — не застосовно до користувацьких облікових записів |
| 11.4/25 | Охоплення власника — 38 підписників у TimoLassmann |
| 21.8/25 | Послужний список — 21 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~12 р. |
| followers | 38 |
| owner_type | User |
| is_verified | — |
| owner_login | TimoLassmann |
| public_repos | 21 |
| account_age_days | 4 454 |
| 25/25 | Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi |
| 35/35 | Свіжість публікацій — остання публікація 125 дн. тому |
| 20/20 | Історія версій — 5 опублікованих версій |
| 20/20 | Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked |
| packages | kalign-python |
| ecosystems | pypi |
| any_deprecated | ні |
| min_days_since_publish | 125 |
Чи наявні базові інженерні практики та документація?
| 24/24 | Процеси CI — 4 процес(ів) CI |
| 24/24 | Наявні тести |
| 16/16 | Конфігурація лінтера — pyproject.toml ([tool.black]) |
| 0/9.6 | Pre-commit-хуки |
| 0/6.4 | .editorconfig |
| 20/20 | OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10 |
| has_ci | так |
| has_tests | так |
| has_editorconfig | ні |
| has_linter_config | так |
| has_precommit_config | ні |
| 30/30 | README |
| 25/25 | Каталог документації |
| 15/15 | Сайт документації / домашня сторінка — https://github.com/TimoLassmann/kalign/blob/main/README.md |
| 10/10 | Опис репозиторію |
| 10/10 | Теми — 3 тем |
| 10/10 | Wiki |
| topics | sequence-alignment, bioinformatics, sequence-analysis |
| has_wiki | так |
| homepage | — |
| docs_site | https://github.com/TimoLassmann/kalign/blob/main/README.md |
| has_readme | так |
| has_docs_dir | так |
| has_description | так |
Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?
| 7.5/7.5 | Binary-Artifacts — no binaries found in the repo |
| 2.2/7.5 | Branch-Protection — branch protection is not maximal on development and all release branches |
| 2.5/2.5 | CI-Tests — 1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10 |
| 0/2.5 | CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0/7.5 | Code-Review — Found 0/4 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 0/2.5 | Contributors — project has 0 contributing companies or organizations -- score normalized to 0 |
| 10/10 | Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected |
| 0/7.5 | Dependency-Update-Tool — no update tool detected |
| 0/5 | Fuzzing — project is not fuzzed |
| 2.5/2.5 | Ліцензія — license file detected |
| 0/7.5 | Maintained — 1 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0 |
| 5/5 | Packaging — packaging workflow detected |
| 0/5 | Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 5/5 | SAST — SAST tool is run on all commits |
| 0/5 | Security-Policy — security policy file not detected |
| 0/7.5 | Signed-Releases — немає даних |
| 0/7.5 | Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions |
| 6.8/7.5 | Vulnerabilities — 1 existing vulnerabilities detected |
| source | openssf_scorecard |
| checks_evaluated | 17 |
| scorecard_version | v5.5.0 |
| checks_inconclusive | 1 |
| scorecard_aggregate | 4,3 |
| 35/35 | Прямі залежності без відомих сповіщень — жодна пряма залежність не має відомих сповіщень |
| 25/25 | Непрямі залежності без відомих сповіщень — жодна непряма залежність не має відомих сповіщень |
| 0/40 | Немає задавнених сповіщень — жодне сповіщення не має дати публікації |
| source | osv |
| advisories | 0 |
| affected_packages | 0 |
| assessed_packages | 1 |
| unassessed_packages | 0 |
| affected_by_severity | none |
| direct_affected_packages | 0 |
Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.
| 45/45 | Інструкції для агентів — CLAUDE.md |
| 0/15 | Машиночитана документація (llms.txt) |
| 24/40 | Читабельна історія комітів — намір зазначено у 45 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст) |
| has_llms_txt | ні |
| llms_txt_url | — |
| legible_history_share | 0,45 |
| agent_instruction_files | CLAUDE.md |
| agent_instruction_max_bytes | 5 171 |
| 0/18 | Розгортання однією командою |
| 22/22 | Автоматизовані тести |
| 11/11 | Конфігурація лінтера / форматера — pyproject.toml ([tool.black]) |
| 11/11 | Статична перевірка типів — python-kalign/py.typed |
| 10/10 | Відтворюване середовище — lockfile |
| 10/10 | Підтверджена практика роботи з агентами — 26 з останніх 100 комітів створено агентом або з його зазначенням |
| 0/8 | Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| has_nix | ні |
| has_tests | так |
| lockfiles | uv.lock |
| has_dockerfile | ні |
| typed_language | так |
| bootstrap_files | — |
| has_devcontainer | ні |
| has_linter_config | так |
| typecheck_configs | python-kalign/py.typed |
| agent_commit_share | 0,26 |
| toolchain_manifests | — |
| dependency_bot_commit_share | 0 |
| 45/45 | Типізований код — C (статично типізована) |
| 55/55 | Керовані розміри файлів — 0/148 файлів вихідного коду понад 60 КБ |
| primary_language | C |
| largest_source_bytes | 43 401 |
| source_files_sampled | 148 |
| oversized_source_files | 0 |
Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.
Кожна точка охоплює 7 днів.
Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).
| 10 | Binary-Artifacts | no binaries found in the repo |
| 3 | Branch-Protection | branch protection is not maximal on development and all release branches |
| 10 | CI-Tests | 1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10 |
| 0 | CII-Best-Practices | no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0 | Code-Review | Found 0/4 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 0 | Contributors | project has 0 contributing companies or organizations -- score normalized to 0 |
| 10 | Dangerous-Workflow | no dangerous workflow patterns detected |
| 0 | Dependency-Update-Tool | no update tool detected |
| 0 | Fuzzing | project is not fuzzed |
| 10 | License | license file detected |
| 0 | Maintained | 1 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0 |
| 10 | Packaging | packaging workflow detected |
| 0 | Pinned-Dependencies | dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 10 | SAST | SAST tool is run on all commits |
| 0 | Security-Policy | security policy file not detected |
| н/д | Signed-Releases | no releases found |
| 0 | Token-Permissions | detected GitHub workflow tokens with excessive permissions |
| 9 | Vulnerabilities | 1 existing vulnerabilities detected |
| Реєстр | Пакет | Обмеження версії | Маніфест |
|---|---|---|---|
| PyPI | numpy | >=1.19.0 | pyproject.toml |
Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 2 прямих і 135 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.
| Реєстр | Пакет | Версія | Зв'язок |
|---|---|---|---|
| PyPI | numpy | 2.4.6 | пряма |
| PyPI | numpy | 2.5.1 | пряма |
| PyPI | about-time | 4.2.1 | непряма |
| PyPI | alabaster | 1.0.0 | непряма |
| PyPI | alembic | 1.18.5 | непряма |
| PyPI | alive-progress | 3.3.0 | непряма |
| PyPI | annotated-types | 0.7.0 | непряма |
| PyPI | array-api-compat | 1.15.0 | непряма |
| PyPI | ast-serialize | 0.6.0 | непряма |
| PyPI | autograd | 1.9.1 | непряма |
| PyPI | babel | 2.18.0 | непряма |
| PyPI | backports-tarfile | 1.2.0 | непряма |
| PyPI | biom-format | 2.1.17 | непряма |
| PyPI | biopython | 1.87 | непряма |
| PyPI | black | 26.5.1 | непряма |
| PyPI | blinker | 1.9.0 | непряма |
| PyPI | build | 1.5.0 | непряма |
| PyPI | certifi | 2026.7.22 | непряма |
| PyPI | cffi | 2.1.0 | непряма |
| PyPI | charset-normalizer | 3.4.9 | непряма |
| PyPI | click | 8.4.2 | непряма |
| PyPI | cma | 4.4.4 | непряма |
| PyPI | colorama | 0.4.6 | непряма |
| PyPI | colorlog | 6.11.0 | непряма |
| PyPI | comm | 0.2.3 | непряма |
| PyPI | contourpy | 1.3.3 | непряма |
| PyPI | coverage | 7.15.2 | непряма |
| PyPI | cryptography | 49.0.0 | непряма |
| PyPI | cycler | 0.12.1 | непряма |
| PyPI | dash | 4.4.1 | непряма |
| PyPI | decorator | 5.3.1 | непряма |
| PyPI | deprecated | 1.3.1 | непряма |
| PyPI | docutils | 0.22.4 | непряма |
| PyPI | execnet | 2.1.2 | непряма |
| PyPI | flake8 | 7.3.0 | непряма |
| PyPI | flask | 3.1.3 | непряма |
| PyPI | fonttools | 4.63.0 | непряма |
| PyPI | graphemeu | 0.7.2 | непряма |
| PyPI | greenlet | 3.5.4 | непряма |
| PyPI | h5py | 3.16.0 | непряма |
| PyPI | id | 1.6.1 | непряма |
| PyPI | idna | 3.18 | непряма |
| PyPI | imagesize | 2.0.0 | непряма |
| PyPI | importlib-metadata | 9.0.0 | непряма |
| PyPI | iniconfig | 2.3.0 | непряма |
| PyPI | itsdangerous | 2.2.0 | непряма |
| PyPI | janus | 2.0.0 | непряма |
| PyPI | jaraco-classes | 3.4.0 | непряма |
| PyPI | jaraco-context | 6.1.2 | непряма |
| PyPI | jaraco-functools | 4.6.0 | непряма |
| PyPI | jeepney | 0.9.0 | непряма |
| PyPI | jinja2 | 3.1.6 | непряма |
| PyPI | kalign-python | 3.6.0 | непряма |
| PyPI | keyring | 25.7.0 | непряма |
| PyPI | kiwisolver | 1.5.0 | непряма |
| PyPI | kneed | 0.8.6 | непряма |
| PyPI | librt | 0.13.0 | непряма |
| PyPI | mako | 1.3.12 | непряма |
| PyPI | markdown-it-py | 4.2.0 | непряма |
| PyPI | markupsafe | 3.0.3 | непряма |
| PyPI | matplotlib | 3.11.1 | непряма |
| PyPI | mccabe | 0.7.0 | непряма |
| PyPI | mdit-py-plugins | 0.6.1 | непряма |
| PyPI | mdurl | 0.1.2 | непряма |
| PyPI | moocore | 0.3.2 | непряма |
| PyPI | more-itertools | 11.1.0 | непряма |
| PyPI | mypy | 2.3.0 | непряма |
| PyPI | mypy-extensions | 1.1.0 | непряма |
| PyPI | myst-parser | 5.1.0 | непряма |
| PyPI | narwhals | 2.24.0 | непряма |
| PyPI | natsort | 8.4.0 | непряма |
| PyPI | nest-asyncio | 1.6.0 | непряма |
| PyPI | nh3 | 0.3.6 | непряма |
| PyPI | optuna | 4.9.0 | непряма |
| PyPI | packaging | 26.2 | непряма |
| PyPI | pandas | 3.0.3 | непряма |
| PyPI | pathspec | 1.1.1 | непряма |
| PyPI | patsy | 1.0.2 | непряма |
| PyPI | pillow | 12.3.0 | непряма |
| PyPI | platformdirs | 4.11.0 | непряма |
| PyPI | plotly | 6.9.0 | непряма |
| PyPI | pluggy | 1.6.0 | непряма |
| PyPI | py-cpuinfo | 9.0.0 | непряма |
| PyPI | pycodestyle | 2.14.0 | непряма |
| PyPI | pycparser | 3.0 | непряма |
| PyPI | pydantic | 2.13.4 | непряма |
| PyPI | pydantic-core | 2.46.4 | непряма |
| PyPI | pyflakes | 3.4.0 | непряма |
| PyPI | pygments | 2.20.0 | непряма |
| PyPI | pymoo | 0.6.2 | непряма |
| PyPI | pyparsing | 3.3.2 | непряма |
| PyPI | pyproject-hooks | 1.2.0 | непряма |
| PyPI | pytest | 9.1.1 | непряма |
| PyPI | pytest-benchmark | 5.2.3 | непряма |
| PyPI | pytest-cov | 7.1.0 | непряма |
| PyPI | pytest-xdist | 3.8.0 | непряма |
| PyPI | python-dateutil | 2.9.0.post0 | непряма |
| PyPI | pytokens | 0.4.1 | непряма |
| PyPI | pywin32-ctypes | 0.2.3 | непряма |
| PyPI | pyyaml | 6.0.3 | непряма |
| PyPI | readme-renderer | 45.0 | непряма |
| PyPI | requests | 2.34.2 | непряма |
| PyPI | requests-toolbelt | 1.0.0 | непряма |
| PyPI | retrying | 1.4.2 | непряма |
| PyPI | rfc3986 | 2.0.0 | непряма |
| PyPI | rich | 15.0.0 | непряма |
| PyPI | roman-numerals | 4.1.0 | непряма |
| PyPI | scikit-bio | 0.7.3 | непряма |
| PyPI | scipy | 1.17.1 | непряма |
| PyPI | scipy | 1.18.0 | непряма |
| PyPI | seaborn | 0.13.2 | непряма |
| PyPI | secretstorage | 3.5.0 | непряма |
| PyPI | setuptools | 83.0.0 | непряма |
| PyPI | six | 1.17.0 | непряма |
| PyPI | snowballstemmer | 3.1.1 | непряма |
| PyPI | sphinx | 9.0.4 | непряма |
| PyPI | sphinx | 9.1.0 | непряма |
| PyPI | sphinx-rtd-theme | 3.1.0 | непряма |
| PyPI | sphinxcontrib-applehelp | 2.0.0 | непряма |
| PyPI | sphinxcontrib-devhelp | 2.0.0 | непряма |
| PyPI | sphinxcontrib-htmlhelp | 2.1.0 | непряма |
| PyPI | sphinxcontrib-jquery | 4.1 | непряма |
| PyPI | sphinxcontrib-jsmath | 1.0.1 | непряма |
| PyPI | sphinxcontrib-qthelp | 2.0.0 | непряма |
| PyPI | sphinxcontrib-serializinghtml | 2.0.0 | непряма |
| PyPI | sqlalchemy | 2.0.51 | непряма |
| PyPI | statsmodels | 0.14.6 | непряма |
| PyPI | tomli | 2.4.1 | непряма |
| PyPI | tqdm | 4.69.0 | непряма |
| PyPI | twine | 6.2.0 | непряма |
| PyPI | typing-extensions | 4.16.0 | непряма |
| PyPI | typing-inspection | 0.4.2 | непряма |
| PyPI | tzdata | 2026.3 | непряма |
| PyPI | urllib3 | 2.7.0 | непряма |
| PyPI | werkzeug | 3.1.8 | непряма |
| PyPI | wrapt | 2.2.2 | непряма |
| PyPI | zipp | 4.1.0 | непряма |
Встановлення pypi:kalign-python@3.6.0 тягне 1 пакетів, прямих і транзитивних: 0 мають відомі сповіщення, з них 0 — прямі залежності.
Жодне відоме сповіщення не стосується оцінених залежностей.
Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.
Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.
Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.
Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.
Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.