ngless-toolkit / ngless
NGLess: NGS with less work
ngless-toolkit/ngless має індекс здоров’я 63 зі 100, що відповідає смузі «Помірний». Найвищий показник — AI Readiness (83/100), найнижчий — Security (38/100). Останнє оновлення було 8 днів тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.
Індекс здоров'я програмного забезпечення
Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).
Профіль оцінок
Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.
Зважений загальний бал 59 калібровано до 63 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).
Власність
За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.
Метрики за категоріями
Життєздатність
Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?
Активність розробки
Як обчислюється оцінка
| 28.8/36 | Свіжість push — останній push 8 дн. тому |
| 6.2/36 | Ритм комітів — 9/52 тижнів із комітами |
| 18/18 | Обсяг комітів — 175 комітів за останній рік |
| 10/10 | OpenSSF Scorecard: Maintained — 16 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
Використані вхідні дані
| commits_last_year | 175 |
| human_commit_share | 1 |
| days_since_last_push | 8 |
| active_weeks_last_year | 9 |
Дисципліна релізів
Як обчислюється оцінка
| 27/27 | Випускає релізи — опубліковано 25 релізів |
| 36/36 | Свіжість релізів — останній реліз 30 дн. тому |
| 12.6/27 | Ритм релізів — реліз кожні ~175,4 дн. |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases. |
Використані вхідні дані
| releases_count | 25 |
| latest_release_tag | v1.6.1 |
| releases_from_tags | ні |
| days_since_latest_release | 30 |
| mean_days_between_releases | 175,4 |
Спільнота та впровадження
Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?
Популярність і впровадження
Як обчислюється оцінка
| 35.3/60 | Зірки — 152 зірок |
| 11.2/25 | Форки — 23 форків |
| 5.3/15 | Спостерігачі — 10 спостерігачів |
Використані вхідні дані
| forks | 23 |
| stars | 152 |
| watchers | 10 |
| growth_state | unverified |
| growth_factor_pct | 100 |
| growth_unverified_reason | no_history |
Здоров'я спільноти
Як обчислюється оцінка
| 22.5/22.5 | README |
| 16.9/22.5 | Ліцензія — файл ліцензії наявний, не є визнаною ліцензією |
| 18/18 | Настанови CONTRIBUTING |
| 0/13.5 | Кодекс поведінки |
| 0/7.2 | Шаблон issue |
| 0/6.3 | Шаблон PR |
Використані вхідні дані
| has_readme | так |
| has_license | так |
| readme_badges | 3 |
| has_contributing | так |
| has_issue_template | ні |
| has_code_of_conduct | ні |
| readme_badge_services | github.com, shields.io |
| has_pull_request_template | ні |
Сталість та врядування
Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?
Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)
Як обчислюється оцінка
| 9/54 | Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів |
| 3.9/22.5 | Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 83% комітів |
| 10.8/13.5 | Широта контриб’юторів — 8 контриб’юторів |
| 10/10 | OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 6 contributing companies or organizations |
Використані вхідні дані
| bus_factor | 1 |
| contributors_sampled | 8 |
| top_contributor_share | 0,827 |
Реактивність на issue та PR
Як обчислюється оцінка
| 31.8/42 | Вирішення issue — закрито 76% issue |
| 26.7/30 | Прийняття PR — злито 24/27 вирішених PR |
| 0/13 | Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка |
| 0/15 | OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| merged_prs | 24 |
| open_issues | 31 |
| closed_issues | 97 |
| prs_merged_7d | 0 |
| prs_decided_7d | 0 |
| prs_merged_30d | 0 |
| prs_decided_30d | 0 |
| issue_closed_ratio | 0,758 |
| closed_unmerged_prs | 3 |
| first_time_authors_30d | 0 |
| first_time_prs_merged_30d | 0 |
| first_time_prs_decided_30d | 0 |
Власність та опіка
Як обчислюється оцінка
| 30/30 | Підтримка власника — у власності організації |
| 0/20 | Верифікований домен |
| 2.2/25 | Охоплення власника — 1 підписників у ngless-toolkit |
| 18.9/25 | Послужний список — 8 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~8 р. |
Використані вхідні дані
| followers | 1 |
| owner_type | Organization |
| is_verified | ні |
| owner_login | ngless-toolkit |
| public_repos | 8 |
| account_age_days | 3 078 |
Інженерна якість
Чи наявні базові інженерні практики та документація?
Інженерні практики
Як обчислюється оцінка
| 24/24 | Процеси CI — 1 процес(ів) CI |
| 24/24 | Наявні тести |
| 0/16 | Конфігурація лінтера |
| 0/9.6 | Pre-commit-хуки |
| 0/6.4 | .editorconfig |
| 0/20 | OpenSSF Scorecard: CI-Tests — немає даних |
Використані вхідні дані
| has_ci | так |
| has_tests | так |
| has_editorconfig | ні |
| has_linter_config | ні |
| has_precommit_config | ні |
Документація
Як обчислюється оцінка
| 30/30 | README |
| 25/25 | Каталог документації |
| 15/15 | Сайт документації / домашня сторінка — https://ngless.readthedocs.io/ |
| 10/10 | Опис репозиторію |
| 10/10 | Теми — 13 тем |
| 10/10 | Wiki |
Використані вхідні дані
| topics | haskell, bioinformatics, bioinformatics-pipeline, samtools, bwa, next-generation-sequencing, fastq-format, fastq, science, ngs, metagenomics, genomics, rust |
| has_wiki | так |
| homepage | https://ngless.readthedocs.io/ |
| docs_site | https://ngless.readthedocs.io/ |
| has_readme | так |
| has_docs_dir | так |
| has_description | так |
Безпека
Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?
Стан безпеки
Як обчислюється оцінка
| 7.5/7.5 | Binary-Artifacts — no binaries found in the repo |
| 0/7.5 | Branch-Protection — branch protection not enabled on development/release branches |
| 0/2.5 | CI-Tests — немає даних |
| 0/2.5 | CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0/7.5 | Code-Review — Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 2.5/2.5 | Contributors — project has 6 contributing companies or organizations |
| 10/10 | Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected |
| 0/7.5 | Dependency-Update-Tool — no update tool detected |
| 0/5 | Fuzzing — project is not fuzzed |
| 2.2/2.5 | Ліцензія — license file detected |
| 7.5/7.5 | Maintained — 16 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| 0/5 | Packaging — немає даних |
| 0/5 | Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 0/5 | SAST — no SAST tool detected |
| 0/5 | Security-Policy — security policy file not detected |
| 0/7.5 | Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases. |
| 0/7.5 | Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions |
| 7.5/7.5 | Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected |
Використані вхідні дані
| source | openssf_scorecard |
| checks_evaluated | 16 |
| scorecard_version | v5.5.0 |
| checks_inconclusive | 2 |
| scorecard_aggregate | 3,8 |
Готовність до ШІ
Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.
Контекст і настанови для агентів
Як обчислюється оцінка
| 45/45 | Інструкції для агентів — CLAUDE.md |
| 0/15 | Машиночитана документація (llms.txt) |
| 40/40 | Читабельна історія комітів — намір зазначено у 83 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст) |
Використані вхідні дані
| has_llms_txt | ні |
| llms_txt_url | — |
| legible_history_share | 0,83 |
| agent_instruction_files | CLAUDE.md |
| agent_instruction_max_bytes | 7 954 |
Як обчислюється оцінка
| 18/18 | Розгортання однією командою — Modules/DogGutCatalog.ngm/1.0/Makefile, Modules/Makefile, Modules/MouseGutCatalog.ngm/1.0/Makefile, Modules/PigGutCatalog.ngm/1.0/Makefile, Modules/igc.ngm/0.5/Makefile, Modules/igc.ngm/1.0/Makefile, Modules/om-rgc.ngm/0.9/Makefile, docs/sources/Makefile |
| 22/22 | Автоматизовані тести |
| 0/11 | Конфігурація лінтера / форматера |
| 11/11 | Статична перевірка типів — Rust (статично типізована) |
| 10/10 | Відтворюване середовище — Nix |
| 10/10 | Підтверджена практика роботи з агентами — 82 з останніх 100 комітів створено агентом або з його зазначенням |
| 0/8 | Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| has_nix | так |
| has_tests | так |
| lockfiles | — |
| has_dockerfile | ні |
| typed_language | так |
| bootstrap_files | Modules/DogGutCatalog.ngm/1.0/Makefile, Modules/Makefile, Modules/MouseGutCatalog.ngm/1.0/Makefile, Modules/PigGutCatalog.ngm/1.0/Makefile, Modules/igc.ngm/0.5/Makefile, Modules/igc.ngm/1.0/Makefile, Modules/om-rgc.ngm/0.9/Makefile, docs/sources/Makefile |
| has_devcontainer | ні |
| has_linter_config | ні |
| typecheck_configs | — |
| agent_commit_share | 0,82 |
| toolchain_manifests | Cargo.toml |
| dependency_bot_commit_share | 0 |
Читабельність коду для моделей
Як обчислюється оцінка
| 45/45 | Типізований код — Rust (статично типізована) |
| 52.3/55 | Керовані розміри файлів — 2/41 файлів вихідного коду понад 60 КБ |
Використані вхідні дані
| primary_language | Rust |
| largest_source_bytes | 252 881 |
| source_files_sampled | 41 |
| oversized_source_files | 2 |
Машиночитні інтерфейси
Як обчислюється оцінка
| 0/40 | Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto) — не застосовно до цього типу програмного забезпечення |
| 0/20 | Сервер MCP — не застосовно до цього типу програмного забезпечення |
| 40/40 | Придатні до запуску приклади — sample |
Використані вхідні дані
| example_dirs | sample |
| has_mcp_signal | ні |
| api_schema_files | — |
| interfaces_expected_of | — |
Ключові факти
Попередження щодо збору даних
- Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
- Could not fetch crates package 'ngless' from its registry
- No resolved dependencies carried a version and a supported ecosystem
Докладніше
Історія зірок і форків 0 ★ / 23 ⇿
Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.
Кожна точка охоплює 8 днів.
OpenSSF Scorecard 3.8 / 10
Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).
| 10 | Binary-Artifacts | no binaries found in the repo |
| 0 | Branch-Protection | branch protection not enabled on development/release branches |
| н/д | CI-Tests | no pull request found |
| 0 | CII-Best-Practices | no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0 | Code-Review | Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 10 | Contributors | project has 6 contributing companies or organizations |
| 10 | Dangerous-Workflow | no dangerous workflow patterns detected |
| 0 | Dependency-Update-Tool | no update tool detected |
| 0 | Fuzzing | project is not fuzzed |
| 9 | License | license file detected |
| 10 | Maintained | 16 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| н/д | Packaging | packaging workflow not detected |
| 0 | Pinned-Dependencies | dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 0 | SAST | no SAST tool detected |
| 0 | Security-Policy | security policy file not detected |
| 0 | Signed-Releases | Project has not signed or included provenance with any releases. |
| 0 | Token-Permissions | detected GitHub workflow tokens with excessive permissions |
| 10 | Vulnerabilities | 0 existing vulnerabilities detected |
Прямі залежності 9
| Реєстр | Пакет | Обмеження версії | Маніфест |
|---|---|---|---|
| crates.io | bzip2 | 0.6.1 | Cargo.toml |
| crates.io | flate2 | 1 | Cargo.toml |
| crates.io | zstd | 0.13.3 | Cargo.toml |
| crates.io | xz2 | 0.1 | Cargo.toml |
| crates.io | serde | 1 | Cargo.toml |
| crates.io | serde_yaml | 0.9 | Cargo.toml |
| crates.io | serde_json | 1 | Cargo.toml |
| crates.io | ureq | 2 | Cargo.toml |
| crates.io | tar | 0.4 | Cargo.toml |
Усі залежності 12
Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 9 прямих і 3 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.
| Реєстр | Пакет | Версія | Зв'язок |
|---|---|---|---|
| crates.io | bzip2 | — | пряма |
| crates.io | flate2 | — | пряма |
| crates.io | serde | — | пряма |
| crates.io | serde_json | — | пряма |
| crates.io | serde_yaml | — | пряма |
| crates.io | tar | — | пряма |
| crates.io | ureq | — | пряма |
| crates.io | xz2 | — | пряма |
| crates.io | zstd | — | пряма |
| crates.io | libc | — | непряма |
| PyPI | guzzle-sphinx-theme | — | непряма |
| PyPI | myst-parser | — | непряма |
Сповіщення про залежності не оцінено
Звірка сповіщень не відбулася для цього звіту: No resolved dependencies carried a version and a supported ecosystem
Звіт у форматі JSON машиночитний
Зворотний зв’язок
Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.
Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.
Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.
Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика.