Усі теги
Тег каталогу

#variant-calling

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

6 записів
З тегом «variant-calling»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
88Відміннийіндекс здоров'я
broadinstitute/viral-ngs
viral-ngs: command line tools and wrappers for processing raw viral genomic data
Python★ 19719 жовт. 2026 р.
MIT19 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
67Добрийіндекс здоров'я
haqaliz/contig
An agentic bioinformatics analyst: it runs the analysis on your own compute, self-heals failures, verifies the output, and returns a reproducible result.
Python · TypeScript★ 2↓ 1 094/міс21 жовт. 2026 р.
Apache-2.021 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
65Добрийіндекс здоров'я
kcleal/dysgu
Toolkit for calling structural variants using short or long reads
Cython · Python · C++★ 117↓ 1 920/міс13 вер. 2026 р.
MIT13 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
48Слабкийіндекс здоров'я
MPUSP/snakemake-simple-mapping
A Snakemake workflow for the mapping of reads to reference genomes, minimalistic and simple.
Python★ 114 вер. 2026 р.
MIT14 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
36Слабкийіндекс здоров'я
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
Опис репозиторію не опубліковано.
TypeScript★ 1↓ 64/міс9 вер. 2026 р.
MIT9 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
26У зоні ризикуіндекс здоров'я
PacificBiosciences/ccs
CCS: Generate Highly Accurate Single-Molecule Consensus Reads (HiFi Reads)
Змішані★ 12713 вер. 2026 р.
BSD-3-Clause-Clear13 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0