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#bioinformatics

Todos los repositorios del registro público que llevan esta etiqueta, procedente de sus topics de GitHub o de las palabras clave que publican sus registros de paquetes. La salud se mide con la misma metodología versionada que el resto del registro.

100 registros
Con la etiqueta «bioinformatics»Ordenado por índice de salud
PyPI
60Moderadoíndice de salud
Electrostatics/mmcif_pdbx
Yet another version of PDBx/mmCIF Python implementation
Python★ 915 jul 2026
CC0-1.015 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · crates.io · npm
60Moderadoíndice de salud
Sigilweaver/OpenTFRaw
Pure-Rust reader for Thermo Fisher .raw mass-spectrometry files, with Python bindings.
Rust★ 12↓ 3365/mes15 jul 2026
Licencia propia15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · npm · crates.io
60Moderadoíndice de salud
illumination-k/pubmed-client
El repositorio no publica descripción.
Rust★ 1↓ 1938/mes18 jul 2026
MIT18 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · Go
60Moderadoíndice de salud
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 4215 jul 2026
Licencia propia15 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm · PyPI
59Moderadoíndice de salud
full-spectrum-analytics/dash-seqviz
A dash wrapper of the javascript DNA, RNA and protein sequence viewer
Python · JavaScript★ 1↓ 317/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
59Moderadoíndice de salud
pepkit/pepdbagent
Database for storing sample metadata
Python★ 2↓ 1314/mes15 jul 2026
BSD-2-Clause15 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm · PyPI
59Moderadoíndice de salud
plotly/dash-bio
Open-source bioinformatics components for Dash
Python · CSS · JavaScript★ 573↓ 566/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · npm
58Moderadoíndice de salud
haqaliz/contig
An agentic bioinformatics analyst: it runs the analysis on your own compute, self-heals failures, verifies the output, and returns a reproducible result.
Python · TypeScript★ 0↓ 0/mes14 jul 2026
Apache-2.014 jul 2026 · métricas 1.13.0
—
57Moderadoíndice de salud
BIoJulia/BIoStructures.jl
A Julia package to read, write and manipulate macromolecular structures
Julia★ 10517 jul 2026
Licencia propia17 jul 2026 · métricas 1.13.0
—
57Moderadoíndice de salud
brentp/somalier
fast sample-swap and relatedness checks on BAMs/CRAMs/VCFs/GVCFs... "like damn that is one smart wine guy"
Nim · HTML★ 32921 jul 2026
MIT21 jul 2026 · métricas 1.13.0
crates.io
57Moderadoíndice de salud
haddocking/haddock-restraints
Generate restraints to be used in HADDOCK
Rust★ 6↓ 54/mes17 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · crates.io
57Moderadoíndice de salud
hfooladi/pdbrust
A Rust library for parsing PDB (Protein Data Bank) files
Rust★ 20↓ 997/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
57Moderadoíndice de salud
igvteam/igv-reports
Python application to generate self-contained pages embedding IGV visualizations, with no dependency on original input files.
Python · HTML★ 435↓ 1420/mes23 jul 2026
MIT23 jul 2026 · métricas 1.13.0
crates.io
57Moderadoíndice de salud
stjude-rust-labs/tes
A crate for working with the Task Execution Service (TES) specification.
Rust★ 13↓ 14.7K/mes23 jul 2026
Apache-2.023 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
56Moderadoíndice de salud
DoctorDean/lazarus
An agent that takes a dead research repo and turns it into a callable pipeline component.
Python★ 13↓ 375/mes17 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
56Moderadoíndice de salud
PDBeurope/rellig
Identifies relevant ligands in the PDB
Python★ 915 jul 2026
Apache-2.015 jul 2026 · métricas 1.13.0
Go
56Moderadoíndice de salud
TimOthYStIles/poly
A Go package for engineering organisms.
Go★ 73117 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
56Moderadoíndice de salud
bioexcel/biobb_common
Biobb_common is the base package required to use the biobb packages.
Python★ 0↓ 1398/mes17 jul 2026
Apache-2.017 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
56Moderadoíndice de salud
elkins-lab/resonance-flow
JAX-native differentiable protein folding framework integrating experimental NMR constraints (RDCs) and biophysical "self-correction." Several Jupyter Notebooks visualize the concepts.
Python★ 117 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
56Moderadoíndice de salud
intersystems-community/iris-vector-graph
High-performance graph database + vector search powered by InterSystems IRIS
Python★ 1↓ 2494/mes19 jul 2026
Licencia propia19 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
56Moderadoíndice de salud
jlsteenwyk/orthosnap
a tree splitting and pruning algorithm for retrieving single-copy orthologs from gene family trees
Python★ 31↓ 221/mes18 jul 2026
MIT18 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
55Moderadoíndice de salud
BioPandas/biopandas
Working with molecular structures in pandas DataFrames
Python★ 75621 jul 2026
BSD-3-Clause21 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
54Moderadoíndice de salud
gmod/g2p_mapper
El repositorio no publica descripción.
TypeScript★ 0↓ 6170/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
53Moderadoíndice de salud
PDBeurope/mmcif-validator
Real-time VSCode extension and standalone Python script for validating mmCIF/CIF files against the PDBx/mmCIF dictionary or any CIF dictionary.
Python · TypeScript★ 1015 jul 2026
Sin licencia15 jul 2026 · métricas 1.13.0
crates.io
53Moderadoíndice de salud
bio-rs/bio-rs
AI-ready biological data I/O, validation, and tokenization engine
Rust · Python★ 315 jul 2026
Licencia propia15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
53Moderadoíndice de salud
electrostatics/apbs
Software for biomolecular electrostatics and solvation calculations
C · Python · MATLAB★ 13417 jul 2026
Licencia propia17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
52Moderadoíndice de salud
elkins-lab/synth-cryo-em
Generate realistic synthetic 3D Cryo-EM densities from structural models for testing algorithms and training ML models.
Python · Jupyter Notebook★ 217 jul 2026
Sin licencia17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
52Moderadoíndice de salud
noahhenrikkleinschmidt/biobuild
A fragment-based molecular assembly toolkit
Python★ 5117 jul 2026
AGPL-3.017 jul 2026 · métricas 1.13.0
—
51Moderadoíndice de salud
CDCgov/irma
IRMA (the Iterative Refinement Meta-Assembler) is a highly configurable and adaptive tool for virus genome assembly.
Perl · Shell★ 2821 jul 2026
Apache-2.021 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
51Moderadoíndice de salud
kmaneesh/biopython-mcp
MCP interface to BioPython
Python★ 2↓ 503/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0