Усі теги
Тег каталогу

#bioinformatics

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

100 записів
З тегом «bioinformatics»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
60Помірнийіндекс здоров'я
Electrostatics/mmcif_pdbx
Yet another version of PDBx/mmCIF Python implementation
Python★ 915 лип. 2026 р.
CC0-1.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · crates.io · npm
60Помірнийіндекс здоров'я
Sigilweaver/OpenTFRaw
Pure-Rust reader for Thermo Fisher .raw mass-spectrometry files, with Python bindings.
Rust★ 12↓ 3 365/міс15 лип. 2026 р.
Власна ліцензія15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · npm · crates.io
60Помірнийіндекс здоров'я
illumination-k/pubmed-client
Опис репозиторію не опубліковано.
Rust★ 1↓ 1 938/міс18 лип. 2026 р.
MIT18 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · Go
60Помірнийіндекс здоров'я
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 4215 лип. 2026 р.
Власна ліцензія15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm · PyPI
59Помірнийіндекс здоров'я
full-spectrum-analytics/dash-seqviz
A dash wrapper of the javascript DNA, RNA and protein sequence viewer
Python · JavaScript★ 1↓ 317/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
59Помірнийіндекс здоров'я
pepkit/pepdbagent
Database for storing sample metadata
Python★ 2↓ 1 314/міс15 лип. 2026 р.
BSD-2-Clause15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm · PyPI
59Помірнийіндекс здоров'я
plotly/dash-bio
Open-source bioinformatics components for Dash
Python · CSS · JavaScript★ 573↓ 566/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · npm
58Помірнийіндекс здоров'я
haqaliz/contig
An agentic bioinformatics analyst: it runs the analysis on your own compute, self-heals failures, verifies the output, and returns a reproducible result.
Python · TypeScript★ 0↓ 0/міс14 лип. 2026 р.
Apache-2.014 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
—
57Помірнийіндекс здоров'я
BIoJulia/BIoStructures.jl
A Julia package to read, write and manipulate macromolecular structures
Julia★ 10517 лип. 2026 р.
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
—
57Помірнийіндекс здоров'я
brentp/somalier
fast sample-swap and relatedness checks on BAMs/CRAMs/VCFs/GVCFs... "like damn that is one smart wine guy"
Nim · HTML★ 32921 лип. 2026 р.
MIT21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
crates.io
57Помірнийіндекс здоров'я
haddocking/haddock-restraints
Generate restraints to be used in HADDOCK
Rust★ 6↓ 54/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · crates.io
57Помірнийіндекс здоров'я
hfooladi/pdbrust
A Rust library for parsing PDB (Protein Data Bank) files
Rust★ 20↓ 997/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
57Помірнийіндекс здоров'я
igvteam/igv-reports
Python application to generate self-contained pages embedding IGV visualizations, with no dependency on original input files.
Python · HTML★ 435↓ 1 420/міс23 лип. 2026 р.
MIT23 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
crates.io
57Помірнийіндекс здоров'я
stjude-rust-labs/tes
A crate for working with the Task Execution Service (TES) specification.
Rust★ 13↓ 14.7K/міс23 лип. 2026 р.
Apache-2.023 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
DoctorDean/lazarus
An agent that takes a dead research repo and turns it into a callable pipeline component.
Python★ 13↓ 375/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
PDBeurope/rellig
Identifies relevant ligands in the PDB
Python★ 915 лип. 2026 р.
Apache-2.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
Go
56Помірнийіндекс здоров'я
TimOthYStIles/poly
A Go package for engineering organisms.
Go★ 73117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
bioexcel/biobb_common
Biobb_common is the base package required to use the biobb packages.
Python★ 0↓ 1 398/міс17 лип. 2026 р.
Apache-2.017 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/resonance-flow
JAX-native differentiable protein folding framework integrating experimental NMR constraints (RDCs) and biophysical "self-correction." Several Jupyter Notebooks visualize the concepts.
Python★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
intersystems-community/iris-vector-graph
High-performance graph database + vector search powered by InterSystems IRIS
Python★ 1↓ 2 494/міс19 лип. 2026 р.
Власна ліцензія19 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
jlsteenwyk/orthosnap
a tree splitting and pruning algorithm for retrieving single-copy orthologs from gene family trees
Python★ 31↓ 221/міс18 лип. 2026 р.
MIT18 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
55Помірнийіндекс здоров'я
BioPandas/biopandas
Working with molecular structures in pandas DataFrames
Python★ 75621 лип. 2026 р.
BSD-3-Clause21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
54Помірнийіндекс здоров'я
gmod/g2p_mapper
Опис репозиторію не опубліковано.
TypeScript★ 0↓ 6 170/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
53Помірнийіндекс здоров'я
PDBeurope/mmcif-validator
Real-time VSCode extension and standalone Python script for validating mmCIF/CIF files against the PDBx/mmCIF dictionary or any CIF dictionary.
Python · TypeScript★ 1015 лип. 2026 р.
Без ліцензії15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
crates.io
53Помірнийіндекс здоров'я
bio-rs/bio-rs
AI-ready biological data I/O, validation, and tokenization engine
Rust · Python★ 315 лип. 2026 р.
Власна ліцензія15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
53Помірнийіндекс здоров'я
electrostatics/apbs
Software for biomolecular electrostatics and solvation calculations
C · Python · MATLAB★ 13417 лип. 2026 р.
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
52Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-cryo-em
Generate realistic synthetic 3D Cryo-EM densities from structural models for testing algorithms and training ML models.
Python · Jupyter Notebook★ 217 лип. 2026 р.
Без ліцензії17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
52Помірнийіндекс здоров'я
noahhenrikkleinschmidt/biobuild
A fragment-based molecular assembly toolkit
Python★ 5117 лип. 2026 р.
AGPL-3.017 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
—
51Помірнийіндекс здоров'я
CDCgov/irma
IRMA (the Iterative Refinement Meta-Assembler) is a highly configurable and adaptive tool for virus genome assembly.
Perl · Shell★ 2821 лип. 2026 р.
Apache-2.021 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
51Помірнийіндекс здоров'я
kmaneesh/biopython-mcp
MCP interface to BioPython
Python★ 2↓ 503/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0