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#genomics

Todos los repositorios del registro público que llevan esta etiqueta, procedente de sus topics de GitHub o de las palabras clave que publican sus registros de paquetes. La salud se mide con la misma metodología versionada que el resto del registro.

22 registros
Con la etiqueta «genomics»Ordenado por índice de salud
PyPI
77Buenoíndice de salud
biopython/biopython
Official git repository for Biopython (originally converted from CVS)
Python★ 513122 jul 2026
Licencia propia22 jul 2026 · métricas 1.13.0
Maven
76Buenoíndice de salud
miso-lims/miso-lims
MISO: An open-source LIMS for NGS sequencing centres
Java · JavaScript★ 30518 jul 2026
GPL-3.018 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · crates.io
71Buenoíndice de salud
genomoncology/biomcp
BioMCP: Biomedical Model Context Protocol
Rust · Python★ 55421 jul 2026
MIT21 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
67Moderadoíndice de salud
iGVteam/igv.js
Embeddable genomic visualization component based on the Integrative Genomics Viewer
JavaScript · HTML★ 728↓ 81.9K/mes17 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
67Moderadoíndice de salud
michael-denyer/jamma
JAMMA (Highly-Accelerated Multi-method Mixed-model Association) -- a fast and modern Python and C reimplementation of GEMMA for large-scale GWAS.
Python · C★ 120 jul 2026
GPL-3.020 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm · crates.io
66Moderadoíndice de salud
GMOD/bbi-js
Parser for bigwig and bigbed files
TypeScript · JavaScript★ 9↓ 13.7K/mes18 jul 2026
MIT18 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
65Moderadoíndice de salud
JLSteenwyk/PhyKIT
a UNIX shell toolkit for processing and analyzing multiple sequence alignments and phylogenies
Python★ 8821 jul 2026
MIT21 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
64Moderadoíndice de salud
gmod/apollo3
Monorepo for Apollo 3 server-side and client-side (JBrowse 2 plugin) components.
TypeScript★ 1518 jul 2026
Apache-2.018 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
63Moderadoíndice de salud
brentp/cyvcf2
cython + htslib == fast VCF and BCF processing
Cython · Python★ 44621 jul 2026
MIT21 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · Go
60Moderadoíndice de salud
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 4215 jul 2026
Licencia propia15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · npm
58Moderadoíndice de salud
haqaliz/contig
An agentic bioinformatics analyst: it runs the analysis on your own compute, self-heals failures, verifies the output, and returns a reproducible result.
Python · TypeScript★ 0↓ 0/mes14 jul 2026
Apache-2.014 jul 2026 · métricas 1.13.0
—
57Moderadoíndice de salud
brentp/somalier
fast sample-swap and relatedness checks on BAMs/CRAMs/VCFs/GVCFs... "like damn that is one smart wine guy"
Nim · HTML★ 32921 jul 2026
MIT21 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
57Moderadoíndice de salud
igvteam/igv-reports
Python application to generate self-contained pages embedding IGV visualizations, with no dependency on original input files.
Python · HTML★ 435↓ 1420/mes23 jul 2026
MIT23 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
56Moderadoíndice de salud
jlsteenwyk/orthosnap
a tree splitting and pruning algorithm for retrieving single-copy orthologs from gene family trees
Python★ 31↓ 221/mes18 jul 2026
MIT18 jul 2026 · métricas 1.13.0
crates.io
55Moderadoíndice de salud
ArcInstitute/binseq
A high efficiency binary format for sequencing data
Rust★ 103↓ 2137/mes21 jul 2026
Sin licencia21 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
51Moderadoíndice de salud
kmaneesh/biopython-mcp
MCP interface to BioPython
Python★ 2↓ 503/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
40En riesgoíndice de salud
goginea/aws-healthomics-ai-troubleshooting-assistant
AI-assisted troubleshooting for AWS HealthOmics genomic workflows with custom knowledge base support
TypeScript★ 0↓ 100/mes17 jul 2026
Licencia propia17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI · npm
40En riesgoíndice de salud
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
El repositorio no publica descripción.
TypeScript★ 117 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
36En riesgoíndice de salud
smartsbio/node-sdk
Official TypeScript/JavaScript SDK for smarts.bio
TypeScript★ 0↓ 73/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
31En riesgoíndice de salud
bbglab/muts-needle-plot
A needle plot for mutation data
JavaScript★ 27↓ 113/mes17 jul 2026
Licencia propia17 jul 2026 · métricas 1.13.0
npm
16Críticoíndice de salud
biojs/generator-biojs-webcomponents
Generate all the boilerplate for your next BioJS tool!
JavaScript★ 10↓ 85/mes17 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0