公开记录
软件健康报告模式 0.23.0 · 指标 2.10.0 · 2026-07-21 21:22 UTC

saezlab / liana-py

LIANA+: an all-in-one framework for cell-cell communication

PythonBSD-3-Clause★ 305 星标⑂ 34 复刻始于 2022年9月在 GitHub 上查看 ↗
类型如何判定

saezlab/liana-py 的健康指数为 100 分中的 88 分,处于「优秀」区间。 其得分最高的类别是Engineering Quality(96/100),最低的是AI Readiness(47/100)。 最近一次更新在 5 天前。 近期的大部分工作由 1 位贡献者完成。

88
总分 / 100
优秀

软件健康指数

指标归入加权类别,统一采用 1–100 量表。总体分先取类别加权平均,再依据公开记录的分布进行校准,使各等级具有百分位含义;当公开证据触发高风险司法辖区政策时,评级会按政策调整,并设置 34(存在风险)的上限。

88
卓越93-100公开记录中的最高层级(约前 5%);基本满足所有检验标准
优秀80-92各方面均表现强劲;仅有少量不足
良好65-79健康;不足之处有限且可控
中等50-64可接受,但存在明显不足;建议进行审查
薄弱35-49多个领域存在实质性薄弱环节
存在风险20-34存在重大薄弱环节;采用时应保持审慎
危急1-19问题严重(项目被弃置、仅有单一维护者、缺乏基本工程规范)
活力社区与采用可持续性与治理工程质量安全AI 就绪度

评分画像

每条轴代表一个类别。形状比平均值更重要——健康的对象会填满整个图形,而“一峰一谷”式画像意味着某一维度的优势正掩盖另一维度的风险。

加权总体分 74 经校准后在公布的指数量表上为 88(记录校准 2026-08-02)。

所有权

Saez Lab组织
487 关注者306 个公开仓库始于 2014年11月

该仓库由组织支持——共同承担、可问责的托管责任,可延续于任何单一维护者之后。

软件包生态系统

注册表软件包版本月下载量版本数最近发布
PyPIliana1.8.1-295 天前

按类别列示的指标

活力

项目是否仍有生命——是否仍在编写代码,是否仍在发布版本?

84优秀 · 占总体的 21%
评分方式
36/36推送新近度最近一次推送于 5 天前
15.2/36提交节奏52 周中有 22 周有提交
18/18提交量最近一年 181 次提交
10/10OpenSSF Scorecard:Maintained30 commit(s) and 7 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
所用输入
commits_last_year181
human_commit_share0.97
days_since_last_push5
active_weeks_last_year22

发布纪律

92优秀
评分方式
27/27有发布版本已发布 24 个发布版本
36/36发布时效最近一次发布版本于 5 天前
19.8/27发布节奏约每 60.5 天发布一次
0/10OpenSSF Scorecard:Signed-Releases无数据
所用输入
releases_count24
latest_release_tagv1.8.1
releases_from_tags
days_since_latest_release5
mean_days_between_releases60.5
已排除计分(无数据或不适用):OpenSSF Scorecard:Signed-Releases。 其余权重已重新归一化。

社区与采用

项目是否拥有用户、下载量与关注度,并具备欢迎贡献者参与的配置?

61中等 · 占总体的 17%
评分方式
40.3/60星标305 个星标
12.7/25复刻34 个复刻
0/15关注者1 位关注者
所用输入
forks34
stars305
watchers1
growth_stateorganic
growth_factor_pct100

社区健康

70良好
评分方式
22.5/22.5README
22.5/22.5许可证可识别的许可证(BSD-3-Clause)
18/18CONTRIBUTING 指南
0/13.5行为准则
0/7.2议题模板
0/6.3PR 模板
所用输入
has_readme
has_license
readme_badges
has_contributing
has_issue_template
has_code_of_conduct
readme_badge_services
has_pull_request_template

可持续性与治理

项目能否在其成员之外延续——巴士系数、响应能力、由谁支持,以及软件包的维护状况?

73良好 · 占总体的 23%
评分方式
9/54巴士系数1 位贡献者贡献了半数提交
8.8/22.5提交分布头号贡献者编写了 61% 的提交
13.5/13.5贡献者广度16 位贡献者
10/10OpenSSF Scorecard:Contributorsproject has 15 contributing companies or organizations
所用输入
bus_factor1
contributors_sampled16
top_contributor_share0.608
评分方式
35.7/42议题解决85% 的议题已关闭
21.6/30PR 接受已裁定的 PR 中 46/64 已合并
0/13Newcomer PR acceptance30 天内没有首次贡献者的 PR 得到裁决
3/15OpenSSF Scorecard:Code-ReviewFound 2/7 approved changesets -- score normalized to 2
所用输入
merged_prs46
open_issues27
closed_issues153
prs_merged_7d
prs_decided_7d
prs_merged_30d
prs_decided_30d
issue_closed_ratio0.85
closed_unmerged_prs18
first_time_authors_30d
first_time_prs_merged_30d
first_time_prs_decided_30d
已排除计分(无数据或不适用):Newcomer PR acceptance。 其余权重已重新归一化。
评分方式
30/30所有权背书组织持有
0/20已验证域名未读取该组织的域名验证状态
19.3/25所有者影响力saezlab 有 487 位关注者
25/25既往记录306 个公开仓库,账户约 11 年
所用输入
followers487
owner_typeOrganization
is_verified
owner_loginsaezlab
public_repos306
account_age_days4,254
已排除计分(无数据或不适用):已验证域名。 其余权重已重新归一化。
评分方式
25/25已发布且可解析pypi 上有 1 个软件包
35/35发布时效最近一次发布于 5 天前
20/20版本历史29 个已发布版本
20/20未被弃用活跃,未被弃用或撤回
所用输入
packagesliana
ecosystemspypi
any_deprecated
min_days_since_publish5

工程质量

基础的工程与文档实践是否到位?

96卓越 · 占总体的 19%

工程实践

94卓越
评分方式
24/24CI 工作流3 个工作流
24/24存在测试
16/16Linter 配置
9.6/9.6Pre-commit 钩子
0/6.4.editorconfig
20/20OpenSSF Scorecard:CI-Tests4 out of 4 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
所用输入
has_ci
has_tests
has_editorconfig
has_linter_config
has_precommit_config

文档

100卓越
评分方式
30/30README
25/25文档目录
15/15文档 / 主页站点http://liana-py.readthedocs.io/
10/10仓库描述
10/10主题标签7 个主题标签
10/10Wiki
所用输入
topicscell-cell-communication, ligand-receptor, python, single-cell, single-cell-rna-seq, spatial, spatialomics
has_wiki
homepagehttp://liana-py.readthedocs.io/
docs_sitehttp://liana-py.readthedocs.io/
has_readme
has_docs_dir
has_description

安全

可见的安全与供应链实践是否稳固,且不存在未解决的高风险司法辖区暴露?

54中等 · 占总体的 16%

安全态势

43薄弱
评分方式
7.5/7.5Binary-Artifactsno binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection无数据
2.5/2.5CI-Tests4 out of 4 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
1.5/7.5Code-ReviewFound 2/7 approved changesets -- score normalized to 2
2.5/2.5Contributorsproject has 15 contributing companies or organizations
10/10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0/7.5Dependency-Update-Toolno update tool detected
0/5Fuzzingproject is not fuzzed
2.5/2.5许可证license file detected
7.5/7.5Maintained30 commit(s) and 7 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
5/5Packagingpackaging workflow detected
0/5Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5Security-Policysecurity policy file not detected
0/7.5Signed-Releases无数据
0/7.5Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
0/7.5Vulnerabilities41 existing vulnerabilities detected
所用输入
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated16
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive2
scorecard_aggregate4.3
已排除计分(无数据或不适用):Branch-Protection, Signed-Releases。 其余权重已重新归一化。
评分方式
35/35直接依赖不含已知公告没有直接依赖携带已知公告
0/25间接依赖不含已知公告在此范围内,传递依赖集合无法与开发和测试依赖区分
0/40没有长期未处理的公告没有公告带有发布日期
所用输入
sourceosv
advisories75
affected_packages13
assessed_packages204
unassessed_packages0
affected_by_severitycritical 2, high 6, moderate 4, low 1
direct_affected_packages0
已排除计分(无数据或不适用):间接依赖不含已知公告, 没有长期未处理的公告。 其余权重已重新归一化。 已将 204 个已解析依赖与 OSV 比对。 该仓库未发布任何索引可解析的软件包,因此改为评估仓库依赖图。该图将开发与测试版本固定同交付的依赖混在一起,因此仅对声明的运行时依赖计分;传递性发现仅作为背景信息列出,不计入评分。 未对可达性进行分析。

AI 就绪度

该仓库在多大程度上具备与 AI 编码代理协同开发与维护的条件?权重刻意设小(4%):代理工具链是一项真实的维护信号,但完全不具备的仓库仍可达到 100/100。

47薄弱 · 占总体的 4%
评分方式
0/45代理指令没有 CLAUDE.md / AGENTS.md / 编辑器规则
0/15机器可读文档(llms.txt)
6.6/40可读的提交历史97 次人类提交中有 12 次说明了意图(结构化标题或解释性正文)
所用输入
has_llms_txt
llms_txt_url
legible_history_share0.124
agent_instruction_files
agent_instruction_max_bytes
评分方式
0/18一条命令的引导启动
22/22自动化测试
11/11Lint / 格式化配置
0/11静态类型检查
10/10可复现环境lockfile
10/10已体现的代理实践最近 100 次提交中有 10 次由代理编写或署名代理
0/8自动化维护未观察到自动依赖更新
0/10OpenSSF Scorecard:Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
所用输入
has_nix
has_tests
lockfilesuv.lock
has_dockerfile
typed_language
bootstrap_files
has_devcontainer
has_linter_config
typecheck_configs
agent_commit_share0.1
toolchain_manifests
dependency_bot_commit_share0
评分方式
0/45可类型检查的代码Python,未配置类型检查
55/55可控的文件大小采样的 106 个源文件中有 0 个超过 60KB
所用输入
primary_languagePython
largest_source_bytes30,684
source_files_sampled106
oversized_source_files0
评分方式
0/40API 模式(OpenAPI/GraphQL/proto)不适用于此类软件
0/20MCP 服务器不适用于此类软件
40/40可运行示例notebooks
所用输入
example_dirsnotebooks
has_mcp_signal
api_schema_files
interfaces_expected_of
已排除计分(无数据或不适用):API 模式(OpenAPI/GraphQL/proto), MCP 服务器。 其余权重已重新归一化。

关键数据

305GitHub 星标
16贡献者
181最近 12 个月提交数
5距最近推送天数
24发布版本数
1巴士系数(bus factor)
27开放议题
PyPI软件包生态系统数

数据采集警告

  • deps.dev does not index pypi:liana@1.8.1; advisories assessed against the repository dependency graph instead

更多细节

Star 与 Fork 历史 305 ★ / 34 ⇿
305Star
34Fork
23发布

每颗 star 和每个 fork 的添加时间,来自 GitHub 并按天汇总。累计增长位于其构成来源——每日新增——的正上方,二者可相互对照:稳定的自然增长与短暂的突增形态截然不同。当这一差别可被衡量时,它会作为增长真实性予以报告。

012525037530534102022-102024-082026-07
主版本 0次版本 8修订 12

每个点涵盖 4 天。

OpenSSF Scorecard 4.3 / 10
4.3综合

来自开源项目 OpenSSF Scorecard 的独立、工具无关的安全评估。每项检查奖励的是安全实践本身,而非特定供应商的工具。Scorecard 无法判定的检查项标记为 不适用,并从安全评分中剔除(绝不按零分计)。Scorecard v5.5.0 · 2026-07-21 21:22 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
不适用Branch-Protectioninternal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md
10CI-Tests4 out of 4 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
2Code-ReviewFound 2/7 approved changesets -- score normalized to 2
10Contributorsproject has 15 contributing companies or organizations
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0Dependency-Update-Toolno update tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
10Maintained30 commit(s) and 7 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
10Packagingpackaging workflow detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0Security-Policysecurity policy file not detected
不适用Signed-Releasesno releases found
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
0Vulnerabilities41 existing vulnerabilities detected
直接依赖 9
注册表软件包版本约束清单文件
PyPIanndata>=0.7.4pyproject.toml
PyPImudatapyproject.toml
PyPIscanpypyproject.toml
PyPInumbapyproject.toml
PyPItqdm>=4.0pyproject.toml
PyPIdocrep>=0.3.1pyproject.toml
PyPIplotnine>=0.10.1pyproject.toml
PyPIsession-info2pyproject.toml
PyPIpandas<3pyproject.toml
全部依赖 204

来自 GitHub 依赖图的完整解析依赖集合:11 个直接依赖与 193 个间接(传递)软件包。仓库提交锁文件时,传递闭包才是完整的。

注册表软件包版本关系
PyPIanndata0.11.4直接
PyPIanndata0.12.7直接
PyPIdocrep0.3.2直接
PyPImudata0.3.2直接
PyPInumba0.63.1直接
PyPIpandas2.3.3直接
PyPIplotnine0.15.2直接
PyPIscanpy1.11.5直接
PyPIscanpy1.12直接
PyPIsession-info20.3直接
PyPItqdm4.67.1直接
PyPIaccessible-pygments0.0.5间接
PyPIadjusttext1.3.0间接
PyPIalabaster1.0.0间接
PyPIappnope0.1.4间接
PyPIarray-api-compat1.13.0间接
PyPIasttokens3.0.1间接
PyPIattrs25.4.0间接
PyPIbabel2.17.0间接
PyPIbackports-tarfile1.2.0间接
PyPIbeautifulsoup44.14.3间接
PyPIbump2version1.0.1间接
PyPIbumpversion0.6.0间接
PyPIcell2cell0.8.4间接
PyPIcertifi2026.1.4间接
PyPIcffi2.0.0间接
PyPIcfgv3.5.0间接
PyPIcharset-normalizer3.4.4间接
PyPIclick8.3.1间接
PyPIcolorama0.4.6间接
PyPIcomm0.2.3间接
PyPIcontourpy1.3.2间接
PyPIcontourpy1.3.3间接
PyPIcorneto0.9.1a6间接
PyPIcoverage7.13.1间接
PyPIcryptography46.0.3间接
PyPIcvxpy-base1.7.5间接
PyPIcycler0.12.1间接
PyPIdebugpy1.8.19间接
PyPIdecorator5.2.1间接
PyPIdecoupler2.1.4间接
PyPIdistlib0.4.0间接
PyPIdocutils0.21.2间接
PyPIdonfig0.8.1.post1间接
PyPIet-xmlfile2.0.0间接
PyPIexceptiongroup1.3.1间接
PyPIexecuting2.2.1间接
PyPIfast-array-utils1.3.1间接
PyPIfastjsonschema2.21.2间接
PyPIfilelock3.20.3间接
PyPIfonttools4.61.1间接
PyPIformulaic1.2.1间接
PyPIformulaic-contrasts1.0.0间接
PyPIgoogle-crc32c1.8.0间接
PyPIgreenlet3.3.1间接
PyPIgseapy1.1.11间接
PyPIh5py3.15.1间接
PyPIhighspy1.12.0间接
PyPIid1.5.0间接
PyPIidentify2.6.16间接
PyPIidna3.11间接
PyPIimagesize1.4.1间接
PyPIimportlib-metadata8.7.1间接
PyPIinflect7.5.0间接
PyPIiniconfig2.3.0间接
PyPIinterface-meta1.3.0间接
PyPIipykernel7.1.0间接
PyPIipython8.38.0间接
PyPIipython9.9.0间接
PyPIipython-pygments-lexers1.1.1间接
PyPIjaraco-classes3.4.0间接
PyPIjaraco-context6.1.0间接
PyPIjaraco-functools4.4.0间接
PyPIjedi0.19.2间接
PyPIjeepney0.9.0间接
PyPIjinja23.1.6间接
PyPIjoblib1.5.3间接
PyPIjsonschema4.26.0间接
PyPIjsonschema-specifications2025.9.1间接
PyPIjupyter-cache1.0.1间接
PyPIjupyter-client8.8.0间接
PyPIjupyter-core5.9.1间接
PyPIkeyring25.7.0间接
PyPIkiwisolver1.4.9间接
PyPIkneed0.8.5间接
PyPIlatexcodec3.0.1间接
PyPIlegacy-api-wrap1.5间接
PyPIlegendkit0.3.6间接
PyPIliana1.7.1间接
PyPIllvmlite0.46.0间接
PyPImarkdown-it-py3.0.0间接
PyPImarkdown-it-py4.0.0间接
PyPImarkupsafe3.0.3间接
PyPImarsilea0.5.7间接
PyPImatplotlib3.10.8间接
PyPImatplotlib-inline0.2.1间接
PyPImdit-py-plugins0.5.0间接
PyPImdurl0.1.2间接
PyPImizani0.14.3间接
PyPImofapy20.7.3间接
PyPImofax0.3.7间接
PyPImore-itertools10.8.0间接
PyPImuon0.1.7间接
PyPImyst-nb1.3.0间接
PyPImyst-parser4.0.1间接
PyPImyst-parser5.0.0间接
PyPInarwhals2.15.0间接
PyPInatsort8.4.0间接
PyPInbclient0.10.4间接
PyPInbformat5.10.4间接
PyPInest-asyncio1.6.0间接
PyPInetworkx3.4.2间接
PyPInetworkx3.6.1间接
PyPInh30.3.2间接
PyPInodeenv1.10.0间接
PyPInumcodecs0.16.5间接
PyPInumpy2.2.6间接
PyPInumpy2.3.5间接
PyPIomnipath1.0.12间接
PyPIopenpyxl3.1.5间接
PyPIpackaging26.0间接
PyPIparso0.8.5间接
PyPIpatsy1.0.2间接
PyPIpexpect4.9.0间接
PyPIpillow12.1.0间接
PyPIplatformdirs4.5.1间接
PyPIpluggy1.6.0间接
PyPIpre-commit4.5.1间接
PyPIprompt-toolkit3.0.52间接
PyPIprotobuf6.33.4间接
PyPIpsutil7.2.1间接
PyPIptyprocess0.7.0间接
PyPIpure-eval0.2.3间接
PyPIpyarrow23.0.0间接
PyPIpybtex0.25.1间接
PyPIpybtex-docutils1.0.3间接
PyPIpycparser3.0间接
PyPIpydata-sphinx-theme0.15.4间接
PyPIpydeseq20.5.2间接
PyPIpydeseq20.5.4间接
PyPIpygments2.19.2间接
PyPIpynndescent0.6.0间接
PyPIpyparsing3.3.2间接
PyPIpyscipopt5.7.1间接
PyPIpytest9.0.2间接
PyPIpython-dateutil2.9.0.post0间接
PyPIpytz2025.2间接
PyPIpywin32-ctypes0.2.3间接
PyPIpyyaml6.0.3间接
PyPIpyzmq27.1.0间接
PyPIreadme-renderer44.0间接
PyPIreferencing0.37.0间接
PyPIrequests2.32.5间接
PyPIrequests-toolbelt1.0.0间接
PyPIrfc39862.0.0间接
PyPIrich14.2.0间接
PyPIrpds-py0.30.0间接
PyPIscikit-learn1.7.2间接
PyPIscikit-learn1.8.0间接
PyPIscipy1.15.3间接
PyPIscipy1.17.0间接
PyPIseaborn0.13.2间接
PyPIsecretstorage3.5.0间接
PyPIsession-info1.0.1间接
PyPIsetuptools80.10.1间接
PyPIsix1.17.0间接
PyPIsnowballstemmer3.0.1间接
PyPIsoupsieve2.8.3间接
PyPIsphinx8.1.3间接
PyPIsphinx-autodoc-typehints3.0.1间接
PyPIsphinx-book-theme1.1.4间接
PyPIsphinx-copybutton0.5.2间接
PyPIsphinx-tabs3.4.7间接
PyPIsphinxcontrib-applehelp2.0.0间接
PyPIsphinxcontrib-bibtex2.6.5间接
PyPIsphinxcontrib-devhelp2.0.0间接
PyPIsphinxcontrib-htmlhelp2.1.0间接
PyPIsphinxcontrib-jsmath1.0.1间接
PyPIsphinxcontrib-qthelp2.0.0间接
PyPIsphinxcontrib-serializinghtml2.0.0间接
PyPIsphinxext-opengraph0.13.0间接
PyPIsqlalchemy2.0.46间接
PyPIstack-data0.6.3间接
PyPIstatannotations0.7.2间接
PyPIstatsmodels0.14.6间接
PyPIstdlib-list0.12.0间接
PyPItabulate0.9.0间接
PyPItensorly0.9.0间接
PyPIthreadpoolctl3.6.0间接
PyPItomli2.4.0间接
PyPItornado6.5.4间接
PyPItraitlets5.14.3间接
PyPItwine6.2.0间接
PyPItypeguard4.4.4间接
PyPItyping-extensions4.15.0间接
PyPItzdata2025.3间接
PyPIumap-learn0.5.11间接
PyPIurllib32.6.3间接
PyPIvirtualenv20.36.1间接
PyPIwcwidth0.3.2间接
PyPIwrapt2.0.1间接
PyPIxlrd2.0.2间接
PyPIzarr3.1.5间接
PyPIzipp3.23.0间接
依赖安全公告 13

该仓库未发布可被索引解析的包,因此评估的是其自身的依赖图——共 204 个包,其中也包含从不交付的开发与测试版本固定:13 个存在已知公告,0 个为直接依赖。

软件包版本关系严重程度公告数修复版本
cryptography46.0.3间接严重748.0.1
pillow12.1.0间接严重3312.3.0
click8.3.1间接18.3.3
protobuf6.33.4间接26.33.5
pyarrow23.0.0间接223.0.1
soupsieve2.8.3间接42.8.4
tornado6.5.4间接126.5.7
urllib32.6.3间接42.7.0
idna3.11间接23.15
pytest9.0.2间接29.0.3
requests2.32.5间接22.33.0
setuptools80.10.1间接283.0.0
pygments2.19.2间接22.20.0

公告表示依赖图中记录的版本落入某条公告的受影响范围。可达性未经分析,且依赖图包含开发与测试的版本固定——某项发现可能只涉及工具链而非交付的软件。

原始 JSON 报告 机器可读

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评分是信号,而非担保。 评分反映的是 GitHub 上公开可见的实践——不是代码审计,也不是安全保证。

缺失数据将被剔除并重新归一化权重,绝不按零分计。方法论已版本化并公开:指标 v2.10.0、模式 v0.23.0—— 完整方法论 · 指标知识库.

单项结果在整体记录中的位置: 汇总统计PyPI.